Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms