Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms