Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SEMA3CQ99985 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3CQ99985 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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