Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SAMD8Q96LT4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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