Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms