Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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