Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms