Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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