Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP7

PCSK9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK9Q8NBP7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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