Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms