Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms