Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC84Q86UT8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms