Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG16L1Q676U5 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG16L1Q676U5 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG16L1Q676U5 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG16L1Q676U5 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG16L1Q676U5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG16L1Q676U5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG16L1Q676U5 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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