Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms