Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms