Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWISTNBQ3B726 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms