Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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