Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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