Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM187BQ17R55 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM187BQ17R55 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM187BQ17R55 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM187BQ17R55 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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