Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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LAMA3Q16787 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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LAMA3Q16787 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA3Q16787 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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