Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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