Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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