Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NTRK3Q16288 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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