Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2F4Q16254 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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