Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 BIVM-201ENST00000257336 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KCNMA1-259ENST00000639406 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CBLB-201ENST00000264122 6780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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