Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms