Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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