Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NAE1Q13564 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms