Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CAMK2DQ13557 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms