Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF5Q12774 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms