Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LDHAP7-201ENST00000398295 965 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HNF4GP1-201ENST00000430567 1249 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FAM177B-204ENST00000445590 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC026401.3-201ENST00000624682 882 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC092894.1-201ENST00000486726 1563 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LMO3-224ENST00000540848 1574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RPL35P3-201ENST00000403133 371 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TMPRSS11GP-201ENST00000431070 1204 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LMNTD1-203ENST00000445693 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms