Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms