Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms