Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms