Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRX3P78415 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRX3P78415 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms