Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms