Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms