Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms