Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms