Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX1P48742 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX1P48742 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.8 ms