Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms