Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FDFT1P37268 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms