Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CASQ1P31415 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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CASQ1P31415 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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