Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRABP1P29762 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRABP1P29762 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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