Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLD1P28340 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLD1P28340 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.7 ms