Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CNTFRP26992 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms