Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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