Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms