Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJA1P17302 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJA1P17302 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA1P17302 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA1P17302 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA1P17302 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA1P17302 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms