Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms